CGM - Département Développement et dynamique cellulaire
Dynamique cellulaire chez la paramécie
Responsable : Jean COHEN
MàJ : 10/01/12
Collaboration
Consortium européen
L'équipe
Anne Aubusson-Fleury, Chargé de Recheche, CNRS
Janine Beisson, Directeur de Recherche Emérite, CNRS
Jean Cohen, Directeur de Recherche, CNRS
Catherine Klotz, Hors cadre
France Koll, Chargé de Recherche, CNRS
Chloé Laligné, Postdoctorante
Martine Le Gouar, Ingénieur d'Etudes, CNRS
Michel Lemullois, Maître de Conférences université Paris-Sud 11
Lei Shi, Doctorant, Univ. Paris-Sud 11
Notre adresse
CNRS - Centre de Génétique Moléculaire
Avenue de la Terrasse - Bât. 26
91198 GIF-SUR-YVETTE Cedex
FRANCE
Tél. : 33 (0)1 69 82 43 73
Fax : 33 (0)1 69 82 31 50
Actualités
Ex-membre de l'équipe et actuellement dans la nouvelle équipe de Linda Sperling, Olivier Arnaiz a été distingué par l’Institut National des Sciences Biologiques et s’est vu attribuer le Cristal du CNRS 2011 pour la qualité de ses travaux d'ingénieur bioinformaticien.
Thématique
Nous utilisons la Paramécie, eucaryote unicellulaire cilié, comme système modèle pour étudier des problèmes de biologie cellulaire. Le séquençage récent du génome de cet organisme ajoute les outils de la génomique aux techniques génétiques, biochimiques et cytologiques développées depuis de nombreuses années dans l’équipe.
Nos activités se focalisent dans deux directions :
- Dans le domaine de la biologie cellulaire, nous poursuivons l’étude de l’assemblage et de la duplication des corps basaux et des structures contractiles associées et nous développons l’étude de la biogenèse des cils.
- Dans le domaine de la génomique, après avoir initié et coordonné le projet génome de la Paramécie en obtenant la réalisation de son séquençage par le Genoscope, nous développons en aval, avec diverses collaborations, plusieurs approches génomiques globales : analyses du transcriptome, du protéome, analyse fonctionnelle de gènes par RNAi, création et développement d’une base de données, ParameciumDB, intégrant les informations issues de l’analyse du génome, de la génétique (collection de souches, résultats du RNAi), du transcriptome et du protéome.
Sélection de publications
- Gogendeau, D., Hurbain, I., Raposo, G., Cohen, J., Koll, F., Basto, R. (2011) Sas-4 proteins are required during basal body duplication in Paramecium. Mol Biol Cell, 22 (7) 1035-44.
- Nowak, J. K., Gromadka, R., Juszczuk, M., Jerka-Dziadosz, M., Maliszewska, K., Mucchielli, M. H., Gout, J. F., Arnaiz, O., Agier, N., Tang, T., Aggerbeck, L. P., Cohen, J., Delacroix, H., Sperling, L., Herbert, C. J., Zagulski, M., Betermier, M. (2011) A functional study of genes essential for autogamy and nuclear reorganization in Paramecium. Eukaryot Cell, 10 (3) 363-72.
- Arnaiz, O., and Sperling, L. (2011) ParameciumDB in 2011: new tools and new data for functional and comparative genomics of the model ciliate Paramecium tetraurelia. Nucleic Acids Research, 39 (Database issue) D632-6.
- Arnaiz, O., Gout, J-F., Bétermier, M., Bouhouche, K., Cohen, J., Duret, L., Kapusta, A., Meyer, E. and Sperling, L. (2010) Gene expression in a paleopolyploid: a transcriptome resource for the ciliate Paramecium tetraurelia. BMC Genomics, 11:547.
- Jerka-Dziadosz, M., Gogendeau, D., Klotz, C., Cohen, J., Beisson, J. and Koll, F. (2010) Basal body duplication in Paramecium: the key role of Bld10 in assembly and stability of the cartwheel. Cytoskeleton (Hoboken) 67 (3) 161-71.
- Laligné, C., Klotz, C., Garreau de Loubresse, N., Lemullois, M., Hori, M., Laurent, F.-X., Papon, J.-F., Louis, B., Cohen, J. and Koll, F. (2010) Bug22p, a conserved centrosomal/ciliary protein also present in higher plants is required for an effective ciliary stroke in Paramecium. Eukaryot Cell, 9 (4) 645-55.
- Beisson, J., Bétermier, M., Bré, M.-H., Cohen, J., Duharcourt , S., Duret, L., Kung, C., Malinsky, S., Meyer, E., Preer, J.-R. and Sperling, L. (2010) Paramecium tetraurelia: The Renaissance of an Early Unicellular Model. CSH Protoc, 2010 (1) pdb.emo140.
Complements to this publication may be found at the following URL: http://paramecium.cgm.cnrs-gif.fr/parawiki/Protocols
- Arnaiz, O., Malinowska, A., Klotz, C., Sperling, L., Dadlez, M., Koll, F. & Cohen J. 2009. Cildb: a knowledgebase for centrosomes and cilia. Database, doi:10.1093/database/bap022.
- Sehring, I., Klotz, C., Beisson, J. and Plattner, H. (2008) Rapid downregulation of the Ca(2+)-signal after exocytosis stimulation in Paramecium cells: Essential role of a centrin-rich filamentous cortical network, the infraciliary lattice. Cell Calcium, 45 (1) 89-97.
- Duret, L., Cohen, J., Jubin, C., Dessen, P., Gout, J., Mousset, S., Aury, J., Jaillon, O., Noel, B., Arnaiz, O., Betermier, M., Wincker, P., Meyer, E. and Sperling, L. (2008) Analysis of sequence variability in the macronuclear DNA of Paramecium tetraurelia: a somatic view of the germ line. Genome Res, 18 (4) 585-96.
- Beisson, J. (2008) Preformed cell structure and cell heredity. Prion, 2 (1) 1-8.
- O'Connor, B. D., Day, A., Cain, S., Arnaiz, O., Sperling, L. and Stein, L. D. (2008) GMODWeb: a web framework for the Generic Model Organism Database. Genome Biol, 9 (6) R102.
- Jaillon, O., Bouhouche, K., Gout, J., Aury, J., Noel, B., Saudemont, B., Nowacki, M., Serrano, V., Porcel, B., Ségurens, B., Le Mouël, A., Lepère, G., Schächter, V., Bétermier, M., Cohen, J., Wincker, P., Sperling, L., Duret, L. and Meyer, E. (2008) Translational control of intron splicing in eukaryotes. Nature, 451 (7176) 359-62.
- Gogendeau, D., Klotz, C., Arnaiz, O., Malinowska, A., Dadlez, M., Garreau de Loubresse, N., Ruiz, F., Koll, F. and Beisson, J. (2008) Functional diversification of centrins and cell morphological complexity. J Cell Sci, 121 (1) 65-74.
- Gogendeau, D., Beisson, J., Garreau de Loubresse, N., Le Caer, J.-P., Ruiz, F., Cohen, J., Sperling, L., Koll, F. and Klotz, C. (2007) A Sfi1p-like Centrin-Binding Protein mediates centrin based Ca2+-dependent contractility in Paramecium. Eukaryot Cell, 6 (11) 1992-2000.
- Arnaiz, O., Cain, S., Cohen, J., and Sperling, L. (2007). ParameciumDB: a community resource that integrates the Paramecium tetraurelia genome sequence with genetic data. Nucleic Acids Res, 35 (Database issue) D439-44.
- Aury, J-M., Jaillon, O., Duret, L., Noel, B., Jubin, C., Porcel, BM., Ségurens, B., Daubin, V., Anthouard, V., Aiach, N., Arnaiz, O., Billaut, A., Beisson, J., Blanc, I., Bouhouche, K., Câmara, F., Duharcourt, S., Guigo, R., Gogendeau, D., Katinka, M., Keller, A-M., Kissmehl, R., Klotz, C., Koll, F., Le Mouël, A., Lepère, G., Malinsky, S., Nowacki, M., Nowak, J-K., Plattner, H., Poulain, J., Ruiz, F., Serrano, V., Zagulski, M., Dessen, P., Bétermier, M., Weissenbach, J., Scarpelli, C., Schächter, V., Sperling, L., Meyer, E., Cohen, J., & Wincker, P. (2006) Global trends of whole-genome duplications revealed by the ciliate Paramecium tetraurelia. Nature, 444(7116):171-178. Link
- Wassmer, T., Kissmehl, R., Cohen, J. et Plattner, H. (2006) Seventeen a subunit isoforms of Paramecium V-ATPase provide high specialization in localization and function. Mol Biol of the Cell, 17: 917-930
- Ruiz, F., Garreau de Loubresse, N., Klotz, C., Beisson, J. and Koll, F. (2005) Centrin deficiency in Paramecium affects the geometry of basal body duplication. Curr Biol, 15 2097-2106.
- Gogendeau, D., Keller, A., Yanagi, A., Cohen, J. and Koll, F. (2005) ND6p, a novel protein wiht RCC1 domains involved in exosytosis in Paramecium. Eukaryotic Cell, 4 2129-2139.
- Ruiz, F., Dupuis-Williams, P., Klotz, C., Forquignon, F., Bergdoll, M., Beisson, J., and Koll, F. (2004). Genetic evidence for interaction between h- and b-tubulins. Eukaryotic Cell 3(1):212-20.
- Zagulski, M., Nowak, J., Le Mouel, A., Nowacki, M., Migdalski, A., Gromadka, R., Noel, B., Blanc, I., Dessen, P., Wincker, P., Keller, A., Cohen, J., Meyer, E., and Sperling, L. (2004). High Coding Density on the Largest Paramecium tetraurelia Somatic Chromosome. Curr Biol 14, 1397-1404.
- Beisson J., Wright M. (2003) Basal body/centriole assembly and continuity. Curr Op Cell Biol 15:96-104.[abstract]
- Beisson, J., J. Clérot, A. Fleury-Aubusson, N. Garreau de Loubresse, F. Ruiz, C. Klotz (2002) Basal body-associated nucleation center for the centrin-based cortical cytoskeletal network in Paramecium Protist 152: 339-354. [abstract]
- Galvani A., L. Sperling (2002) RNA interference by feeding in Paramecium. Trends Genet. 18 :11-2. [abstract]
- Sperling L, P. Dessen, M. Zagulski, R.E. Pearlman, A. Migdalski, R. Gromadka, M. Froissard, A.M. Keller, J. Cohen. (2002) Random sequencing of Paramecium somatic DNA Eukaryotic cell, 1 :341-352.
- Ruiz, F, A. Krzywicka, C. Klotz., A.M. Keller, J. Cohen, F. Koll, G. Balavoine, and J. Beisson. (2000) The SM19 gene, required for duplication of basal bodies in Paramecium, encodes a novel tubulin, h-tubulin. Current Biology, 10 : 1451-1454. [abstract]
Pour en savoir plus
Biogénèse des corps basaux et des cils :
- Biogénèse des corps basaux et des structures contractiles associées
- Biogénèse des cils : la paramécie comme modèle pour l’étude de maladies génétiques humaines
Des mécanismes d'évolution des espèces éclairés par le génome de la Paramécie
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